学校和实验中心各实验室均制订有仪器设备管理的相关制度和措施。学校制订有《中国地质大学(北京)实验室安全管理工作规定》、《中国地质大学(北京)实验室安全管理细则》、《中国地质大学(北京)仪器设备管理办法》、《中国地质大学(北京)危险化学品安全管理办法》、《实验教学中心(实验室)先进集体及先进个人评选奖励办法》、《实验教学中心(实验室)建制管理暂行办法》、《中国地质大学(北京)教学实验室(中心)档案和基本信息管理办法》《中国地质大学(北京)教学实验室(中心)开放基金管理办法》、《中国地质大学(北京)低值品、材料、易耗品管理办法》。地质学实验教学中心根据学校相关文件制订有《地质学实验教学中心仪器设备管理制度》、《地质学实验教学中心损坏、丢失仪器赔偿制度》、《地质学实验教学中心低值品、易耗品、材料管理办法》等,确保了实验仪器的良好维护和运行。
所有实验室和野外实习基地均执行安全事故一票否决制度,建立并强调安全巡查和专人负责制度,确保实验、实习安全平稳运行。